Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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