Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms