Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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C4orf17Q53FE4 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C4orf17Q53FE4 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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