Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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