Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms