Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms