Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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SS18Q15532 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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SS18Q15532 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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SS18Q15532 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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SS18Q15532 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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SS18Q15532 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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