Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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