Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms