Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL19A1Q14993 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms