Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CHD4Q14839 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CHD4Q14839 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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