Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms