Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL4AQ13619 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL4AQ13619 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL4AQ13619 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL4AQ13619 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL4AQ13619 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4AQ13619 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4AQ13619 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4AQ13619 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4AQ13619 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4AQ13619 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4AQ13619 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4AQ13619 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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