Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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