Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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AP3B2Q13367 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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AP3B2Q13367 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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AP3B2Q13367 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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AP3B2Q13367 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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