Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PPP2R2B-211ENST00000508545 2042 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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