Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CENPFP49454 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CENPFP49454 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CENPFP49454 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
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