Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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