Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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