Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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ZNF548Q8NEK5 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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ZNF548Q8NEK5 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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ZNF548Q8NEK5 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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ZNF548Q8NEK5 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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