Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR629-201ENST00000385230 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TTLL11-IT1-201ENST00000411790 1052 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC007036.1-201ENST00000430537 674 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TISP43-205ENST00000440359 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HOXB-AS1-203ENST00000504972 680 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AARSP1-201ENST00000514795 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC104984.4-201ENST00000577420 224 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC008991.1-201ENST00000591285 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC068888.1-205ENST00000607643 662 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ANKMY2-205ENST00000627859 210 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FMO10P-201ENST00000455032 1493 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OCM-201ENST00000242104 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF254-201ENST00000339642 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU1-8P-201ENST00000384328 165 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM14EP-201ENST00000408960 378 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms