Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
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LAMA3Q16787 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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LAMA3Q16787 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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LAMA3Q16787 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
LAMA3Q16787 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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