Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SS18Q15532 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SS18Q15532 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SS18Q15532 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SS18Q15532 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SS18Q15532 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SS18Q15532 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SS18Q15532 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SS18Q15532 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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SS18Q15532 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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