Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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