Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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