Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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