Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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