Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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