Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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