Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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