Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms