Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PGGT1BP53609 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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