Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRZ1P23471 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRZ1P23471 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRZ1P23471 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRZ1P23471 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRZ1P23471 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRZ1P23471 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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