Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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