Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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PTPRBP23467 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPRBP23467 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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