Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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CLDN9O95484 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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CLDN9O95484 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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CLDN9O95484 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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CLDN9O95484 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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CLDN9O95484 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLDN9O95484 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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