Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RFXAPO00287 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RFXAPO00287 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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RFXAPO00287 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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RFXAPO00287 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RFXAPO00287 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RFXAPO00287 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RFXAPO00287 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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