Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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