Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms