Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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