Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms