Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHD4Q14839 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHD4Q14839 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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