Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF2H3Q13889 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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