Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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ATP1A4Q13733 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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ATP1A4Q13733 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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ATP1A4Q13733 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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ATP1A4Q13733 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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