Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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