Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC008738.6-201ENST00000604605 569 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC02059-202ENST00000506471 2094 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms