Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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