Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEMA3BQ13214 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3BQ13214 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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