Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms