Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms